Propositions de stages de M2
pour l’ensemble de la spécialité SBCP pour l’année 2018 – 2019
À l’attention des équipes d’accueil :
Les étudiants du parcours Biophysique font un stage en laboratoire à temps plein d’environ 5 mois. Le stage débute fin janvier et est précédé d’une semaine de “découverte” du labo et du sujet de stage (mi janvier). Cette semaine doit, entre autre, leur permettre d’exposer la semaine suivante lors de notre semaine transplantée à Roscoff, le but de leur stage dans son contexte (aucun résultat n’est bien sûr demandé, mais un certain recul sur leur futur travail).
Les étudiants des parcours Interface Physique-Biologie (IPB) et Physique de la Matière et Biologie (PMB) commence par un premier stage de janvier à mars à mi-temps (3 jours de stage par semaine, en parallèle de cours), puis un second (qui peut, ou non, être la poursuite du premier) à temps plein d’avril à juin.
Un colloque aux thèses est organisé le mercredi 17 octobre 2018. Les laboratoires sont invités à y présenter leurs propositions sous forme d’affiches. C’est l’occasion de rencontres et discussions entre les étudiants de la spécialité et les chercheurs.
Le stage donne lieu à un rapport écrit et une soutenance orale qui sont généralement organisés dans le courant de la 3e semaine de juin.
Calendrier
Les propositions de stage doivent être déposées sur le site de préférence entre septembre et octobre. Les étudiants d’IPB et PMB ont la possibilité de commencer un second stage en mars, donc il est possible de déposer des propositions de stage jusqu’à février. Les propositions de thèse peuvent être déposées tout au long de l’année.
Si vous souhaitez déposer une proposition de stage,
veuillez remplir le petit formulaire ci-dessous
Liste des propositions :
À l’attention des étudiants : la liste des propositions de stages ci-dessous est actualisée régulièrement. Nous vous encourageons donc à revenir souvent sur cette page pour voir les mises à jour.
La liste des propositions de stages et thèses 2018-2019 est disponible ici:
- Linking simulation to continuous mechanics of biological materials
- THESE PHARE CEA: QUANTITATIVE SUPER RESOLUTION MICROSCOPY AT CRYOGENIC TEMPERATURE
- NanoViro
- Hydrodynamic of acive fluids
- Rôle de PARP3 dans la mécanotransduction du muscle squelettique
- Diagramme de phase de cellules épithéliales
- Migration of breast cancer cells on biocompatible wires
- Development, characterization and control of E. coli communities on an automated experimental platform
- Mitochondrial Cristae and their role in ATPsynthase functioning
- Study of the collective dynamics of self-propelled nano-rods or bacteria under acoustic confinement
- Spatial organization and dynamics of DNA repair mechanisms, a single-molecule microscopy approach
- Mitochondria cristae dynamics: an active membrane model
- 3D Optical imaging of fast dynamics in Zebrafish embryos
- Neural circuits underlying decisions and sequences
- Characterization of phage-host interaction using acoustic waves confinement.
- Rôle des lipides dans la fusion mitochondriale
- Étude biophysique de l’interaction de la protéine Pin1 avec une nouvelle génération de peptides fluorés
- Mise au point de techniques de microscopie confocale en feuillet de lumière pour l’étude des interactions hôte-agents pathogènes entériques
- Formation de kystes rénaux.: étude de l’organisation et de la dynamique de modèles cellulaires de polykystose dans des environnements 3D biomimétiques
- Unsupervised learning of temporal sequences in spiking networks with STDP
- Coupled receptor-scaffold dynamics in the dendritic membrane
- Biomechanics of somite formation in chicken embryo
- Mécanique multi-échelle des caillots veineux
- Membranes biomimétiques pour l’étude des mitochondries
- Control of the shape of an aggregate in acoustic levitation and application to tissue engineering
- Étude de la dynamique de processus biologiques à l’intérieur du noyau d’une cellule vivante.
- Development of a new cryo-electron tomography (cryo-ET) image analysis approach to conformational variability of biomolecular complexes
- Development of an image analysis approach to analyze conformational variability of biomolecular complexes by X-ray free electron laser (XFEL) technology
- Improvements of a cryo-EM data analysis methodology for analyzing continuous conformational changes of biomolecular complexes
- Development of a new cryo-electron microscopy (cryo-EM) image analysis approach to conformational variability of biomolecular complexes
- Development of an image analysis approach to analyze conformational variability of biomolecular complexes by X-ray free electron laser (XFEL) technology
- Reconstituting a minimal cell
- Nouvelle approche de Microscopie super-résolue pour la biologie
- Morphogenèse d’un système complexe
- Mesure des forces cellulaires à l’intérieur d’un tissu : compréhension multi-échelle de la différentiation des cellules musculaires dans des tissus modèles
- Viral and colloidal 3D superlattices assembled in microfluidic channels
- Biophysics of bacterial biofilms in porous micro-bioreactors.
- Construction pratique d’une description générale multi-échelle des biopolymères
- Mécanique du cortex cellulaire
- Théorie des liquides pour l’auto-assemblage moléculaire
- Accurate Atomistic Models for Computer-Aided Drug Design
- Biophysics of Paramecium, a “swimming neuron”
- High speed super-resolution microscopy to decipher membrane dynamics within living cells
- Microfluidic study of the self organization of ciliary activity and mucus transport in reconstituted human bronchial epithelium
- Molecular simulation of the TPR domain closure of KLC (kinesin1 light chain)
- Cells in a hypoxic environment: the race for oxygen
- Development of a multimodal microscope for quantitative imaging of encapsulated drug distribution in multicellular tumor spheroids
- Application of microfluidic tools to decipher blood cell interactions with blood vessels
- Characterization of phage-host interaction using acoustic waves confinement.
- Biophysics of gut homeostasis establishment in gut on chip system
- Microfluidic control of blastocyst in vitro development
- Application of microfluidic tools to decipher blood cell interactions with blood vessels
- Development of a multimodal microscope for quantitative imaging of encapsulated drug distribution in multicellular tumor spheroids
- Cells in a hypoxic environment: the race for oxygen
- Structure of Vap-OSBP complex involved in membrane contact site by cryo-EM
- What is the concentration of a single molecule ?
- Intersystem crossing in fluorescent proteins: a novel mechanism for dynamic contrast in fluorescence imaging ?
- PhD program at the Francis Crick Institute-Imperial College-UK
- Mathematical and in-silico modelisation of normal and malignant HSC in their niche and of their interactions with stromal cells
- Sphéroïdes 3D pour l’étude de la destruction magnéto-mécanique de cellules cancéreuses
- What is the concentration of a single molecule ?
- Bacterial adaptation by OXPHOS dynamics: from single cell biology to gut microbiota
- Structural analysis of particles resulting from the association of membrane proteins, lipids and amphipathic polymers
- Interplay between flows and contractile activity in giant unicellular organism P. Polycephalum
- Couplage mécano-chimique dans l’assemblage des filaments d’actine
- Ingénierie des protéines fluorescentes pour l’imagerie
- Spectromicroscopie électronique vibrationnelle pour l’étude de matériaux hybrides nanostructurés
- Imagerie et analyse chimique de biomatériaux à l’échelle du nanomètre
- Réseau de micro-organismes : coopération et/ou compétition
- Mécanique des globules blancs
- Engineering biological nanopores for single-molecule sensing
- Understanding transcription regulation mediated by KRAB zinc fingers
- Non-equilibrium modeling of biological processes
- Machine learning approach to pseudo-temporal ordering of super-resolution images
- Measuring the physical properties of femtoliter volumes in cells with single particle tracking
- Segmentation Timing and Dynamics in Developing Embryos
- Bacterial mechanosensing
- Suivi de nanoparticules individuelles dans des cellules neuronales
- Fluorescent nanodiamonds as intracellular sensors
- Ionic liquids for DNA sequencing with solid state nanopores
- Nanofluidics of Nanocapillaries and DNA Translocations
- Modeling and measuring to build physical understanding in systems biology
- Caractérisation d’un système de balayage, basé sur un miroir MEMS, dédié à l’imagerie endomicroscopique.
- Fusion membranaire sur billes magnétiques
- SIGNALING OF THE MECHANOTRANSDUCER YAP IN CANCER COLLECTIVE MOTILITY
- Motile bacteria in an hour-glass
- Subcellular refractometry with scanning Bessel-beam TIRF excitation and confocal SAF detection
- Nanopatterned Attachment for Nanometric Optical Standardization, Calibration and Length Estimation (NANOSCALE)
- Light-induced reaction mechanisms in flavoproteins
- Multicolor 3D SELFI super-resolution microscopy
- Understanding and Controlling Gut Peristaltic Movements
- dynamiques en gradient de température pour la synthèse de polyphosphates
- Validation du principe d’une pompe à chaleur photochimique
- Hydrodynamics in the cytoplasm and division positioning
- Characterisation of gold nanoparticles intracellular degradation and their impact of the lysosome integrity
- Optimisation des méthodes d’acquisition et d’analyse d’images de durée de vie de fluorescence (FLIM) avec camera intensifée à porte temporelle : application en biologie
- Numerical modeling of living tissues
- PhD Program at University of Geneva
- Investgation the control of nuclear size during replicative aging : a tug of war between the nucleolus and the cell
- Investigation budding yeast adaptation to a spatial gradient of oxidative stress
- Building a chemostat to minotor the adaptation to complex stress patterns in a population of cells
- Mesure des forces cellulaires à l’intérieur d’un tissu : compréhension multi-échelle de la différentiation des cellules musculaires
- Control of neuronal by posttranslational modification of the microtude cytoskeleton
- Etude structurale des cibles thérapeutiques des gaz nobles par modélisation moléculaire et cristllographie des protéines
- Etude de la dynamique d’agrégation sous haute pression de protéines végétales en vue d’applications dans les domaines de l’agroalimentaire et des biomatériaux
- Matière active programmable
- Cartographie des contraintes mécaniques pendant la formation des agrégats cellulaires
- Structure par cryoEM des assemblages multiprotéiques impliqués dans la résolution des jonctions de Holiday en méiose
- Microfluidique pour la biologie moléculaire
- Etude biochimique et structurale d’enzymes de thilation des ARNt cruciales pour la fidélité de la traduction génétique et la réponse cellulaire aux stress
- Validation de peptidomimétiques pour cibler le virus de la bronchiolite
- Physics of Microbes
- Proposition Adaptation of Neisseria meningitidis to the microenvironment induced upon vascular colonization
- Proposition Biophysics of host/pathogen interaction during Neisseria meningitidis infection